Пространство БФУ включает в себя учебные корпуса, библиотеки, лаборатории, симуляционные аудитории, фабрику, спортивные центры и ботанический сад.

Главный корпус

Адрес: ул. А. Невского, 14., Корпус №1

Конференц-комплекс, ректорат, администрация университета

Библиотека. Институт живых систем

Адрес: ул. Университетская , 2, Корпус №3

Библиотека

Медицинская библиотека

Адрес: ул. 9 Апреля, 5, Корпус №8

Медицинская библиотека

Научно-технологический парк «Фабрика»

Адрес: г. Калининград, ул. Гайдара 6,

Научно-технологический парк «Фабрика»

Физкультурно-оздоровительный комплекс

Адрес: ул. А. Невского, 14. Корпус №9

Физкультурно-оздоровительный комплекс

Учебно-физкультурный комплекс с бассейном

Адрес: ул. А. Невского, 14.

Учебно-физкультурный комплекс с бассейном