БФУ им. И. Канта является ключевым элементом региональной инновационной инфраструктуры, обеспечивающим достижение высокого уровня конкурентоспособности Калининградской области, а также положительную динамику инновационного развития реального сектора экономики.

Целью и задачами деятельности инновационной инфраструктуры является выстраивание эффективных цепочек взаимодействия «университет — предприятие», а также формирование модели последовательной подготовки кадров для инновационной экономики. Это коррелирует со стратегией  развития университета и  способствует реализации национальных проектов и развитию экономики Калининградской области и России в целом.

Университет является площадкой для взаимодействия по созданию, коммерциализации разработок и технологий как российского, так и мирового уровня.  Научные коллективы участвует в проектах мирового уровня совместно с такими организациями, как: Юлихский исследовательский центр (Германия), Институт им. Пауля Шеррера (Швейцария), Центры синхротронного излучения ESRF (Франция) и DESY (Германия).

Основные функции университета в качестве инновационного хаба:

• Реализация системы непрерывного повышения квалификации специалистов учебных, промышленных, научных и научно-исследовательских предприятий и организаций.
  
• Генерация новых идей для технологического предпринимательства.
  
• Адаптация и создание новых технологий для модернизации существующих производств.
  

• Экспертный центр содействия в решении проблем социально-экономического спектра.