Цифровое моделирование химических процессов

Проект «Цифровые кафедры»



2 семестра


продолжительность обучения

286 часов


общая трудоемкость


Руководитель программы

Чупахин Евгений Геннадьевич
Чупахин Евгений Геннадьевич
доцент ОНК «Институт медицины и наук о жизни»
Отсутствуютchupakhinevgen@gmail.com

Из чего состоит программа?

1

МОДУЛЬ 1: Алгоритмизации и языки программирования

Темы

Тема 1. Цифровая культура
Тема 2. Дискретная математика в программировании
Тема 3. Введение в программирование
Тема 4. Прикладное программирование (на примере языка Fortran)
Тема 5. Прикладное программирование (на примере языка Python)

2

МОДУЛЬ 2: Вычислительные методы в химии и технологии

Темы

Тема 1. Статистическая обработка данных в химии и технологии
Тема 2. Базы данных и программные продукты
Тема 3. Моделирование структуры веществ и материалов в программе USPEX
Тема 4. Молекулярный дизайн биологически активных молекул

2

МОДУЛЬ 3: Компьютерный дизайн в открытии лекарств

Темы

Тема 1. Молекулярные дескрипторы
Тема 2. QSAR анализ
Тема 3. Молекулярный докинг
Тема 4. Основы работы в среде Maestro Shrodinger
Тема 5. Алгоритм Glide
Тема 6. Алгоритм ComFA
Тема 7. Алгоритм LigandPrep
Тема 8. Автоматизация виртуального скрининга
Тема 9. Дизайн библиотек химических соединений
Тема 10. Работа с алгоритмом AlphaFold

3

ПРАКТИКА

На базе 1С-компаний

4

ИТОГОВАЯ АТТЕСТАЦИЯ

В формате демонстрационного экзамена (защита портфолио или выполнение проекта)


ВЫ УЗНАЕТЕ

  • принципы написания скриптов и обработки данных
  • принципы построения регрессионных моделей и визуализации результатов
  • метод USPEX для моделирования новых кристаллических структур
  • пакет Schrodinger для виртуального скрининга и построения моделей «структура — активность»
  • программу AlphaFold для предсказания структуры белков-мишеней

ВЫ НАУЧИТЕСЬ

  • программированию на Python и Fortran для решения химических задач
  • работать с профессиональными инструментами компьютерного дизайна
  • использовать машинное обучение для QSAR-анализа
  • работать с большими данными и нейросетями


Как проходит обучение?
Обучение проходит в онлайн-формате на платформе lms.kantiana.ru. Весь лекционный материал представлен в виде записанных видеолекций, практические занятия проводятся в формате вебинаров через сервис Яндекс Телемост по заранее утвержденному расписанию. Запись вебинаров также выкладывается в курсе на lms. Практика организована в ИТ-компаниях также в дистанционном формате.

Что нужно для успешного освоения программы?
В ходе обучения по каждому модулю выставляется зачет на основании просмотров видеолекций, посещения вебинаров, выполнения заданий и онлайн-тестирования. Зачет по практике выставляется на основании выполнения индивидуального или коллективного проекта. Итоговая аттестация по программе проводится в формате оценки портфолио (все выполненные в течение обучения работы/проекты/тесты), онлайн-тестирования или выполнения проектной работы.

Для каких направлений подготовки подходит программа?

Программа разработана для отрасли химия (органический синтез, конструирование лекарств, химические источники тока) и здравоохранение (фармакология) и подходит для студентов направлений:

04.03.01 Химия
04.04.01 Химия
06.05.01 Биоинженерия и биоинформатика


Вопросы, связанные с реализацией программы, Вы можете задать по почте digitaledu@kantiana.ru



Партнеры программы


Личный кабинет для cтудента

Личный кабинет для cтудента

Даю согласие на обработку представленных персональных данных, с Политикой обработки персональных данных ознакомлен

Подтверждаю согласие